南方科技大学生物医学工程系（以下简称“生医工系”）成立于2016年6月，现任系主任为蒋兴宇讲席教授（哈佛博士、国家杰出青年）。系核心教师共计35名，其中3名讲席教授，1名教授。多名教师获得“国家杰出青年基金”、“国家自然科学优秀青年基金”等项目和奖励。研究方向包括力学应用医学、可穿戴设备及无线健康监控、原位再生工程、多尺度和多模式生物医学影像、大数据和健康信息学的计算医学、生物医学微机电系统与纳米医学。

目前，哥伦比亚大学生物医学工程系全力支持南方科技大学建设生物医学工程系，生医工系借鉴了哥伦比亚大学生物医学工程系的培养课程，并建立了加强版的哥伦比亚大学生物医学工程的培养思路，与哥伦比亚大学一起联合培养本、硕、博学生。

生医工系确立了Adventurous（勇于冒险）、Arduous（甘于艰苦）、Amiable（乐于和谐）的“AAA”建系文化。生医工系正处在快速发展的黄金时期，将为每位教授提供充足的实验室和办公空间。生医工系诚邀海内外优秀人才加入，共创一个多学科交叉创新的研究平台，依托南方科技大学一流的科研、教学条件，力争将生医工系建设成为国际知名的生物医学工程研究基地。