南科大计算科学与工程系成立于2016年。目前本系已有全职教师47名，均在海外知名大学获得博士学位或有多年教学与研究的工作经验。其中，IEEE会士3名，IET会士1名。重点发展人工智能、数据科学、计算机系统和网络、医学影像、计算机与网络安全、软件工程等方向，致力于建设成为计算机学科领域国际知名的研究型计算机科学与工程系。

本系培养具有坚实的计算机科学与技术理论知识，初步掌握前沿的计算机系统的设计原理，拥有相应的研发能力，同时具备英语和计算机应用能力，可从事计算机科学与技术和相关交叉学科领域研发的高素质科技人才。学生毕业后能从事计算机系统与应用的设计、研发等方面工作，也适宜继续攻读与计算机相关研究生学位，可在科研部门、教育单位、企业、事业、技术和行政管理、服务行业部门从事计算机教学、科学研究和应用的工作。