为响应国家加快和深化工程教育改革的号召，同时发挥南方科技大学在高等教育改革中的先导和示范作用，南方科技大学工学院在2015年5月成立。       

工学院设有力学与航空航天工程系、机械与能源工程系、材料科学与工程系、电子与电气工程系、计算机科学与工程系、 海洋科学与工程系、生物医学工程系、 环境科学与工程学院、深港微电子学院（国家示范性微电子学院）、系统设计与智能制造学院等10个系（院）。同时下设斯发基斯可信自主研究院、复杂流体及软物质研究中心、创新材料研究院、深圳可持续发展研究院、创新智造研究院、碳中和能源研究院、纳米科学与应用研究院、精密光学工程中心、半导体外延与器件研究院、先进网络研究院、机器人研究院、人工智能高等研究院、物质微观科学技术研究院13个研究机构。  

工学院现拥有2个博士后科研流动站，7个学术博士学位授权点，3个专业博士学位授权点，8个学科硕士学位授权点，5个专业硕士学位授权类别，开设22个本科专业。同时建设有4个国家级科研平台，28个省部级科研平台，50个市级科研平台。工学院面向海内外选聘人才，已基本建成一支高水平的师资队伍。工学院现有教师330人，其中，院士23人，教育部特聘教授（含青年）23人，国家自然科学基金杰出青年25人。  

工学工学院积极开展国际交流与合作，已与加州大学伯克利分校、加拿大约克大学、新加坡国立大学、香港理工大学、京都大学等高校建立了密切联系。  

展望未来，工学院将国家发展和产业需求与人才培养相结合，知识传授与能力培养一体化，不断探索新工科人才培养模式，注重培养具有国际视野、厚基础、强实践能力的复合型创新领军人才，努力建成国际一流工学院，助力粤港澳大湾区经济可持续发展。

（更新于2025年5月）